脑分水岭梗死病因和普通脑梗死或脑血栓形成的病因相同，主要有以下几个方面：
1、最多见的是血管壁问题，如高血压、糖尿病、高血脂，诱发导致动脉血管壁损伤，引起动脉粥样硬化，在粥样硬化的基础上导致血管狭窄。当血流缓慢时，血液中流动的其它栓子经过时容易发生梗死；
2、血流动力学原因，如病人存在心衰、心脏排血量明显下降、血流缓慢、血流量降低等情况下，也可以引起梗死；
3、血液中的成分发生改变，如部分人平时脸特别红，这种患者需要检查血液中的成分是否增多，如红细胞、血小板、纤维蛋白原增多，经过血管时容易堵塞狭窄血管；
4、其它原因，如感染，部分年轻人感冒、发烧也可引起炎症，对血管造成损伤，也可导致脑梗死。