牙周炎治疗是序列化治疗，在医学上，牙周炎治疗主要是以局部治疗为主，配合全身的用药。全身用药有以下几种：
1、抗菌素药物：如硝基咪唑类，常见有甲硝唑、替硝唑、奥硝唑；四环素类药，包括四环素、强力霉素、米诺环素。
2、大环内酯类药物：如螺旋霉素；
3、中成药方面，如以六味地黄丸为基础的，专门针对牙周炎的固齿丸、固齿膏，都可以治疗牙周炎；
4、改善宿主，改善人体机能的药物，最常见的是消炎痛、多西环素、吲哚美辛。其中，吲哚美辛原来也叫消炎痛；
5、局部口腔含漱类药物：包括局部冲洗药，最常见的是过氧化氢、氯己定溶液。