患者肛瘘到医院以后，首先要进行一些基本检查：
1、首先要找到肛瘘的发生部位，肛位以点位来计算，就是把肛门看成钟。那么首先要看肛瘘发生的部位，有开口的肛瘘，可以看到在肛门的几点钟发现外口，然后要摸清肛瘘的走向，如条索状肿块的走向。有的肛瘘可能是盲端瘘，可能看不到外口，但是可以摸到条索状肿块，作为医生而言是第一资料。要看，然后要摸，第三个要指诊，指诊就是了解肛瘘在肛门里面的具体的部位，这些只是初步的检查或者初步的意见；
2、患者必须要做进一步的检查，因为专科医院有专科条件，比如有经过直肠腔内的三维彩超，这个检查非常必要，就是非常重要的检查方法。将B超的探头放在肛门、直肠里面，通过三维图像就可以了解肛瘘的走向、肛瘘的发生部位，以及肛瘘与括约肌之间的关系，通过图像可以建立肛瘘走向的立体观，给手术提供一个非常好的术前指引；
3、对一些非常复杂的高位肛瘘，还要做进一步的检查，要做肛管周围的核磁共振。通过核磁共振可以清楚看见每一根瘘管的走向。通过彩超、手摸、核磁共振，就可以基本在手术之前，把整个肛瘘的立体形象规划出来。然后根据肛瘘的立体的形象，设计手术的方案，就是术前必须要完成的一些步骤。