有些小孩表现很不典型，有时以发烧起病，有时以刺激性干咳起病。另外，还有少部分患者不是以呼吸道症状起病，而是以肺外症状起病，比如心血管疾病、中枢神经系统疾病，肾脏疾病起病的支原体感染也不少见。
呼吸道支原体感染往往表现为高热不退，多见于年长儿，早期主要表现为咳嗽、发热、刺激性干咳，临床症状很重，但是肺部体征很轻、没有啰音，但是胸部X线改变又很典型、很严重，所以支原体感染的特点是体征和症状、X线检查不符。这部分患儿要到医院做检查，由呼吸科医生做出检查后明确诊断，可以选择阿奇霉素或者红霉素进行正规、足疗程治疗，才能痊愈，尽早诊断、合理治疗可以避免并发症发生。