脑部是人体最复杂的地方，掌管着人体的动作、语言、思维、记忆等，脑部病变可能损伤脑部的这些复杂功能，导致严重的后果，具体如下：
1、婴幼儿化脓性脑膜炎：预后比较严重，目前合理的抗生素治疗、支持治疗可降低患儿的死亡率。死亡率跟患儿的年龄、病原菌、脑脊液中细菌量、治疗前惊厥时间等因素有关。约10%-20%的幸存者可以出现神经系统严重的后遗症，包括智力倒退、反复惊厥、语言能力延迟、听力受损、视力模糊、行为异常；
2、病毒性脑炎：病程大多是2-3周，多数患儿可完全治愈，少数临床病情重、全脑弥漫性病变者可能遗留惊厥及智力、运动、心理行为、视力及听力残疾；
3、结核性脑膜炎：预后与治疗早晚、患儿年龄、疾病的分型分期、结核分枝杆菌的耐药性有关。结核性脑膜炎的治疗越晚，孩子年龄越小，病死率越高。结核性脑膜炎的严重后遗症是脑积水、肢体瘫痪、智能低下、失明、失语、癫痫、尿崩症等。