纤维支气管镜的适应症有很多，在儿科，最常见的适应症有：
1、慢性刺激性咳嗽，针对慢性刺激性咳嗽做支气管镜的目的主要是进一步的明确诊断；
2、局限性的喘鸣，一般出现局限性喘鸣多半可能存在有局部气道不通畅，可以通过支气管镜了解气道不通畅的相关的原因；
3、针对肺不张或者是阻塞性肺气肿的患儿，可以通过支气管镜进一步明确诊断，也可以通过支气管镜来吸引出引起肺不张的黏稠痰液，而起到治疗作用；
4、支气管肺部炎症的病原学检查和治疗，对难治性的肺部感染，可以通过支气管镜留取生物标本，做病原学检查，同时也可以局部给药促进肺部炎症的好转；
5、咯血或者是痰中带血的诊断和治疗；
6、对局限性或者是弥漫性肺部的阴影的诊断和鉴别诊断；
7、可以在支气管镜引导下进行气管插管；
8、在外科手术特别是胸外科手术之前，可能需要行支气管镜检查，通过支气管镜了解气道有无畸形。