肛周脓肿引流管拔管时间取决于脓肿是否基本清理干净，脓腔内脓液和坏死组织是否消失，不能以时间界定。肛周脓肿在诊断和治疗时，应区别脓肿为单纯皮肤表面脓肿或肛瘘等深层感染性脓肿。
为治疗肛周脓肿，除引流外，一旦明确为肛瘘，将瘘管完整切除，使新生肉芽组织由内向外生成，治疗肛瘘才可使肛周脓肿彻底消失。
在肛门内、外有小口，两个口连接形成弯曲、扭转窦道，此窦道称之为肛瘘。此肛周脓肿常表现为反复发作、迁延不愈，即便脓肿破溃、消失，甚至外表恢复，不久再次于同部位出现脓肿、破溃。此时应高度警惕，不为皮肤软组织表浅感染，来自于直肠、肛管深层。