头部手术的后遗症需根据病情的具体情况而定，在当前显微神经外科技术的发展下，患者术后的并发症已较少。术前已经昏迷或位于脑重要部位的肿瘤，或对重要血管、神经有包绕或有侵犯的肿瘤，术后可能会留有一定并发症，包括偏瘫、偏身感觉障碍、失语、肢体麻木、昏迷等。
重症的患者、术前可能已经昏迷的患者或严重的脑损伤患者，术后可能出现长期昏迷甚至植物生存。植物生存可能出现各种并发症，如肺部感染、泌尿系感染、压疮、肢体肌肉的废用性萎缩等。对于常见的肿瘤患者，术后并发症越来越低，大部分颅脑肿瘤患者开颅后，不会有严重并发症，绝大多数患者可以 恢复到正常人状态。