对于卵巢囊肿，如果是生理性囊肿，可能下个月经周期或者过2-3个月经周期，囊肿会自然消退，被身体吸收。而如果是病理性囊肿，可能无法通过自身吸收，需要手术治疗，为最快的治疗方式。
但是手术是有创操作，需要评估囊肿手术的获益与手术风险，评估是否值得手术。但剥除卵巢囊肿再进行缝合，有时在随访B超时，可能发现囊肿还在，因为剥除卵巢囊肿，缝合剩余卵巢，做B超发现的小囊肿，可能是有线结以及少量渗血，过一段时间也可能会被吸收。所以消除病理性卵巢囊肿，最快的方法是手术。现在绝大多数卵巢囊肿都采用腹腔镜手段，如果怀疑囊肿是恶性，在手术方式的选择可能有不同的意见。