头部有较多穴位，艾灸可以灸头部。多数患者觉得艾灸头部可能会引起上火，但实际上艾灸头部的主要目的是驱寒邪、提升阳气。阳气下泄会导致较多疾病发生，如中气下泄会出现胃下垂、子宫脱垂、脱肛，均可通过灸百会穴进行治疗。同时可以通过艾灸治疗阳虚引起的失眠，如灸印堂、四神聪穴治疗。
此外，灸风池穴、风府穴、阿是穴，可以治疗风寒引起的头痛，偏侧头痛可以灸率谷穴、太阳穴。但肝阳上亢或出现上火症状时，不要用艾灸灸头部，否则可能会使病症越来越明显。所以灸头部不是依据症状，主要是需要辨证是何种证型再进行灸治，才能获得良好效果。