溶栓药物主要针对于血管内形成血栓进行溶解的药物。因为各种因素导致血管内壁的纤维蛋白单体的形成，形成血栓后会堵塞血管。这时需要一种药物溶解血栓。目前临床上最常用的药物是阿替普酶，英文缩写是rt-PA，是针对于4.5小时之内的缺血性卒中和6小时之内发生心肌梗死的患者，较为有效的一种溶栓药物。还有国产的尿激酶，也是针对血栓溶解的药物，用于部分缺血性脑卒中发病6小时以内的患者，一种溶栓的常用药物。
目前推行的脑卒中急性期规范救治溶栓的指南中，国际指南一级推荐阿替普酶作为溶栓药物，中国指南对于发病6小时以内的患者推荐溶栓药物。还有部分正在进行Ⅱ期和Ⅲ期临床研究的新型 溶栓药，例如替奈普酶，英文缩写TNK。目前正在进行相关的临床研究。随着研究越来越深入，作用靶点更准确、半衰期时间更长、副作用更少的新型溶栓药物会加入溶栓药的行列中。