气管食管瘘为呼吸科、胸外科、肿瘤科综合疾病，治疗相对困难。具体治疗方法如下：
1、手术治疗：若为良性瘘且部位较局限，可采用手术方法修补或将该段瘘部位切除。但恶性瘘通常难以进行手术，术后易复发，修补困难；
2、支架堵塞瘘：常用气管、食管支架。若患者为单纯气管狭窄，无食管狭窄，可选用气管支架。具体根据患者情况进行选择；
3、放入引流管：食道分泌物中存在异物，易呛到气管中，可放入引流管；
4、加强营养：患者往往无法进食，需做胃肠外营养；
5、加强抗感染：选择合理的抗生素，必要时可于气管镜下将痰液、分泌物吸出。