乙肝两对半代表抗原抗体系统，主要是告诉患者是否感染了乙肝，现在是什么阶段，是否需要治疗。两对半的两对指的是表面抗原和表面抗体，e抗原和e抗体，以及半个是核心抗体。表面抗原代表是否感染，和病毒并不呈正相关，而表面抗体代表保护性的抗体，可以通过感染乙肝获得保护性的抗体，也可以通过注射疫苗获得，只是对同型的病毒具有保护，如果是不同的亚型或者低滴度过低的时候也不具有保护性。
e抗原代表是现症感染或者是既往感染，e抗体代表是病毒的清除。核心抗原分为IgM和IgG，IgM代表是现症的感染，而IgG同样代表的是既往的感染。所以乙肝两对半常见是大三阳，即第一项、第三项和第五项 是阳性，一般这样的人病毒是阳性。