药流不干净是否会来月经，主要看宫内残留组织是否有活性，具体如下：
1、不会来月经：如果宫内残留组织有活性，还能释放HCG，激素没有恢复正常，月经就不会来潮；
2、会来月经：如果宫内残留组织没有活性，不会释放HCG值，月经就可以恢复，而且随着月经恢复之后，这个残留物可能会随着月经排出去。
针对残留物是否有活性，宫腔残留的处理方法也不一样，如果药流不干净，测HCG值是阴性，没有活性，这时候阴道出血不多，这就可以期待月经来潮，等月经来潮之后，残留物也许就可以排出去。但如果测HCG值是阳性，宫腔残留组织还有活性，就会造成出血，不会使月经来潮，这种情况可能就需要手术 把残留物清除，清除完以后月经才可以恢复。