生理期偏头痛与女性月经期间体内激素分泌水平变化有关，生理期偏头痛可通过口服药物缓解，常见的药物包括非甾体类的消炎镇痛药，研究表明非甾体类消炎镇痛药对轻、中度偏头痛发作或既往使用药物有效的重度偏头痛患者，可作为一线药物，主要药物有对乙酰氨基酚即散利痛、塞来昔布即西乐葆、布洛芬缓释胶囊即芬必得。而特异性药物包括曲普坦类药物，如舒马普坦，还有麦角胺类药物如麦角胺咖啡因等，特异性药物通常用于比较严重或者重度偏头痛患者。若偏头痛患者生活质量、工作或学业严重受到影响，不能正常工作或学习，偏头痛发作频率高，每月发作在两次 以上，可以选择使用预防性药物治疗，具体如下：
1、β受体阻滞剂在偏头痛预防性治疗方面效果比较明确，常用倍他乐克；
2、钙离子拮抗剂中的非特异性钙离子通道阻滞剂，比如氟桂利嗪，即西比灵，可有效预防偏头痛；
3、抗癫痫药物，常用丙戊酸钠预防偏头痛，托吡酯是抗癫痫药物，也可以有效预防偏头痛；
4、抗抑郁药，目前唯一有研究证实有效药物是阿米替林，所以也可使用阿米替林预防偏头痛。