标准的基础体温测定，在每天经过充足的睡眠以后，清醒后不做任何事情，包括说话、喝水等，然后第一时间将体温计放入舌下来测量体温，测5分钟后记录体温计的温度。基础体温的测定通常用来监测排卵，在生殖领域和妇科内分泌治疗的领域中，是最基本的检测的手段。
正常人的体温在月经来潮的第一天到排卵前，处于一种正常的状态，一直维系到女性排卵日当日。排卵时由于受体内孕激素和雌激素的影响，体温会比正常的情况下升高0.3-05℃，而呈现相对高的体温状态，会持续14天。一直到月经来潮时，由于雌孕激素水平的下降而回落到基础的状态，又 称为基础体温双相。如果在月经周期中没有出现基础体温双相的情况，提示没有排卵。如果持续的时间比较短，提示黄体功能不足，所以基础体温的测量是监测排卵和检测黄体期的重要方式。