宝宝半夜咳嗽原因非常多，较常见的半夜咳嗽，可能是患儿气道着凉引起。因为现在发现有一部分儿童，尤其是合并有过敏性鼻炎的儿童，对冷空气过敏，运动以后也有可能会出现痉挛性咳嗽，但是这一部分咳嗽通常都是以干咳为主，没有痰。尤其是合并有过敏性鼻炎的儿童，鼻腔分泌物会通过鼻腔，往后倒流影响到咽喉，顺而往下影响到气管，也会引起到咳嗽。还有一种就是鼻后滴漏综合征，其实也是鼻炎引起，就是有很多分泌物和黏液通过鼻腔后部影响到咽喉，影响到气管，这是引起干咳、咳嗽较常见的原因。
小朋友半夜咳嗽还有其它常见原因，就是人体激素水平在11点以后是分泌高峰，到下半夜以后激素水平较低。若本身是有呼吸道感染，就像很多小朋友经常是晚上发烧情况类似 ，激素水平比较低。所以晚上尤其是下半夜就容易出现发烧、咳嗽这些呼吸道症状。也可能是早期表现出呼吸道症状，以咳嗽为主，继而会出现其它伴随症状。包括有鼻塞、流鼻涕、发烧这些伴随症状可能随后也会出现。
还有婴儿会出现胃食管反流，胃食管反流是胃里面的液体、食物反流上来，影响刺激到咽喉部，也会引起半夜咳嗽，引起刺激性咳嗽。还有心功能不好的患儿，尤其是合并有先天性心脏病、心功能衰竭，甚至有小孩出现心律失 常。这一部分儿童也有可能会下半夜出现咳嗽，但是这些有心功能不好的儿童或心律失常的儿童出现下半夜的咳嗽，也会有伴随症状，如脸色差、精神不好、头晕、甚至是有晕厥的情况，这个情况是要及时就诊。半夜咳嗽的原因会非常的多，具体的情况要具体的分析。