衣原体实验室检查包括抗原检测、细胞培养和核酸检测。细胞培养是诊断衣原体感染的金标准，也就是最靠谱的检查手段。但细胞培养成本比较高，技术难度大，很难在临床上广泛应用，所以目前比较推广更敏感、更有特异性的核酸检测方法。
生殖道衣原体感染多发生在性活跃人群，主要经性接触传染。当机体抵抗力差、生殖道黏膜局部有小破损时，衣原体可以通过破溃处进入局部组织。感染衣原体潜伏期一般是1-3周，大约一半以上患者没有症状。
有症状的男性主要表现为尿道炎，出现尿道刺痒、少数有尿痛，尿道口红肿，尿道分泌物呈浆液性等症 状，50%-60%淋病可合并衣原体的感染；女性衣原体感染主要表现为黏液性宫颈炎，出现白带增多、宫颈水肿或糜烂等症状。