结肠癌和直肠癌首先是部位不同，消化道里的肠分为小肠和大肠，结肠癌从盲肠开始，经升结肠、横结肠、降结肠，再到乙状结肠，最后是直肠。所以二者的解剖学的区别在于直肠癌是末端的肠段发生癌变，一般长度在15cm左右，而结肠癌从盲肠开始，大概有1.5m左右。
虽然结肠癌和直肠癌统称为结直肠癌，但在治疗方面也有区别。结肠癌以手术为主，并配合化疗综合治疗。直肠癌因为位置低，解剖位置比较特殊，所以特别对于低位的直肠癌，要进行保肛治疗。但低于5cm以下的直肠癌患者肛门不一定能保住，所以对于直肠癌可能会在常规化疗的基础上再加上局部的放疗。
综上， 直肠癌和结肠癌的区别在于治疗和部位两个方面。