强直性脊柱炎的病因较复杂,目前尚无确切的病因,研究已经发现,强直性脊柱炎与人体的遗传因素、环境因素,感染等因素明显相关,特别是已经证实的,与人类的白细胞抗原HLA-B27基因,具有明显的相关性,在健康人群该基因的阳性率有2%-7%,而在强直性脊柱炎患者中,该基因的阳性率可高达90%。此外,吸烟也是强直性脊柱炎重要的诱发及预后不良因素,应尽早戒烟。