格林-巴利综合征的治疗分为一般治疗和病因治疗。病因治疗是针对格林-巴利综合征的疾病原理，即疾病的病因。由于格林-巴利综合征是一种免疫性的周围神经病，治疗时要用免疫球蛋白，还会采用血浆置换的办法，通过血浆置换把体内的抗体置换出来，达到治疗的目的。临床上这两个办法一般不同时使用，如果急用时，需先进行血浆置换。如果效果不好，可以辅助给予免疫球蛋白的输注治疗。
有些情况还会给患者进行激素治疗，但一般患者用激素的效果均不太理想。但在没有免疫球蛋白，又无法进行血浆置换的条件下，可以考虑应用糖皮质激素进行治疗。在治疗过程中，如有肺部感染，要给予相应的抗生素，有胃肠道损害要给予保护胃黏膜等治疗。后期针对患者的神经功能的恢复，要给予康复治疗。通过以上的综合治疗，大多数患者可达到较好的临床转归。