中药白芷多用川白芷及祁白芷的根，其味香、辛，性温，具有祛风解表、散寒止痛、除湿通窍、消肿排脓的功效。临床中多用来治疗感冒、鼻塞、头痛、脘腹痞闷、食欲不振，以及乳腺小叶增生、乳房结节、乳腺感染等。
值得一提的是，白芷历代被视为美容佳品，可研末外敷，可以改善人体微循环，促进皮肤新陈代谢，消除色素在组织中过度的堆积，去除面部的色斑、瘢痕，治疗皮肤疱、痍、疥、癣等疾病。
另外其具有较长的光敏作用，可以用来治疗白癜风。现代药理研究表明，白芷具有抗炎、抗菌、解热、镇痛、解痉、增强心肌收缩力的作用。阴虚火旺者禁用白芷。