手术分流是治疗脊椎空洞症的一个比较常用的方法，但是脊髓空洞症的治疗方法比较多，具体选用何种治疗方法主要取决于脊髓空洞的原因。由于外伤、炎症或者其他因素导致空洞，如果没有明确需要去除的原因，可以对空洞进行分流手术。空洞的分流手术可以将脊髓空洞分流到椎管的蛛网膜下腔，也可以根据就近的位置分流，比如胸段的脊髓空洞可以分流到蛛网膜下腔或者胸腔，腰段的脊髓空洞也可以分流到相应的蛛网膜下腔。
此外，脊髓空洞症最常见的原因是小脑扁桃体下疝，英文名称Chiari畸形，是由于先天或者后天的原因引起小脑扁桃体肥大 ，疝入枕骨大孔，影响颅颈交界区的脑脊液循环，造成脊髓的中央网扩张，逐渐形成脊髓空洞。所以这类疾病的治疗方式是进行后颅窝减压和颅底重建手术，从根源治疗脊髓空洞。