骨肿瘤的切除手术需考虑多方面的因素，如术后如何重建、重建后的恢复情况以及对功能丧失情况进行评估等，再结合患者的年龄、肿瘤生长的部位等情况，进行综合的评估，才可选择手术方式。若为良性骨肿瘤，通常切除即可达到治疗的目的。若为恶性骨肿瘤，需结合具体情况，选择手术的方式。具体如下：
1、囊内切除：即在肿瘤内部进行操作，可有肿瘤组织的残留，易复发。囊内切除适用于良性肿瘤及不能完全切除的肿瘤，如跖骨内生软骨瘤等；
2、边缘切除：即在肿瘤包膜外进行的切除手术，可在包膜外发生肿瘤的残留情况，复发率较高。适用于良性的骨肿瘤，如骨软骨瘤，及部分软组织肿瘤的切除治疗；
3、扩大切除：此类手术切除范围较大，可切除部分肿瘤外的正常组织及内部的微小病灶，因此其复发率与以上两种相比有所降低；
4、根治性切除：切除的范围比扩大切除大，即将肿瘤的全部组织切除，复发率更低。但此种手术方法形成的缺损较多，给患者带来的缺失更明显。