巧克力囊肿属于卵巢激素相关疾病，随着卵巢每个月分泌激素，巧克力囊肿可能逐渐加重，如果不进行治疗，可能出现以下情况：
1、痛经：巧克力囊肿较小时可能无明显症状，待巧克力囊肿逐渐加重，患者可能出现痛经，初始时疼痛较轻，后期疼痛逐渐加重，可能影响上班或学习，严重时需要服用止痛药物进行治疗；
2、慢性盆腔痛：部分患者即使不来月经时也会疼痛，称慢性盆腔痛；
3、囊肿破裂：部分巧克力囊肿生长较大后，可能自行破裂而导致患者产生剧烈腹痛；
4、其它症状：部分患者可能出现性交痛、怀孕困难或怀孕后易流产等情况。
上述均是巧克力囊肿可能产生的危害，如果患者发现巧克力囊肿，建议及时进行治疗。