自然流产孕囊排出时间取决于患者子宫收缩强度。有的患者吃药以后，分分钟就可排出，有的患者需要2-3小时，甚至更长时间。自然流产也类似，如果子宫肌肉收缩较好很快就可排干净。如果子宫肌肉收缩不好，会持续很长时间，临床有患者持续几天甚至几周。对于这类患者主要是看阴道出血的量，如果量特别多要谨慎不全流产，这时要尽快处理；如果量很少有可能已经流干净。所以在临床不讨论时间长短，关键是看出血量会不会给患者带来更多麻烦。
时间长短除观察出血以外，如果需要特殊处理，也要根据出血状况判断。如果很快就没有出血或者量很少，可以判断已经排干净，但是最 终标准是要以B超作为衡量。如果排干净就给予支持治疗，回家观察即可。对于没有全排干净者，即所谓的不全流产，为了避免后期出现严重状况，可以用加强子宫收缩的药物，比如催产素帮助尽快恢复；也可用活血化瘀药物，比如生化汤等帮助排出。如果这些方法都不合适，可以用清宫的方法，即通过类似人工流产方法解决问题。