临床上主要针对停育胚胎进行胚胎染色体检查，而胚胎染色体检查的主要范围如下：
1、染色体的数目异常：正常人类具有23对染色体，并且23对染色体均成对出现，所以临床上称之为二倍体。对于停育的胚胎，临床上应检查其染色体是否为二倍体、三倍体，或者其中某对染色体出现三体，比如21三体综合征、18三体综合征，或者13三体综合征；
2、染色体的内部结构异常：部分染色体虽然可成对出现，但是其内部结构可能出现缺失、中间断裂以后倒位，以及平衡易位等问题。通过胚胎的染色体检查可以判断胚胎停育的原因，如果因为染色体异常造成胚胎停育，则染色体异常较为严重，可能为多倍体，亦可能为某几条或某一条染色体出现缺失、三倍体，或者单倍体，这种染色体的严重异常方可造成胚胎停育，而染色体的轻微异常不一定造成胚胎停育。染色体出现轻微异常的胚胎如果存活下来，有可能导致胎儿出现较为严重的先天性遗传病。