怀孕出现褐色分泌物的原因，需要根据怀孕具体的孕周来确定，具体如下：
一、怀孕早期：
1、宫外孕：明确妊娠位置，宫外孕早期最常见的症状是腹痛和阴道出血；
2、先兆流产：如果已经明确是宫内妊娠，则为先兆流产，首先明确是否有胎芽和胎心，早孕期大多数胚胎丢失，即70%以上的胚胎丢失都是胚胎染色体问题导致，该类先兆流产无法避免。早孕期时会先看是否有胎芽和胎心，如果已经有胎芽和胎心，大多预后较好，如果没有胎芽和胎心，或者已经明确诊断胎停育，则属于自然淘汰的过程，多数都是染色体异常造成。
二、怀孕中晚期：
可能是先兆晚 期流产或者先兆早产的表现，要根据情况除外有无胎盘位置异常、宫颈息肉等情况。
总之，孕期出现阴道出血属于不正常的现象，如果出现该类情况，需要及时到产科门诊就诊。