患者在抗痨结束治疗后症状如果未完全恢复，通常进入长期的慢性后遗症期，需进行长期功能锻炼与家庭护理，后遗症可能终身存在，给患者与家庭造成负担。结核性脑膜炎是死亡率、致残率较高的疾病，治疗成功主要取决于能否早期诊断、早期治疗。目前结脑早期诊断缺乏敏感性高、特异性强的检查手段。不典型结核性脑膜炎病例存在逐年增多趋势，导致较多结脑出现误诊造成预后不良，患者死亡率达到15%-20%。后遗症较多见，主要后遗症包括以下几方面：
1、肢体活动障碍：占到患者总数20%-25%，如偏瘫、共济失调等；
2、视听觉障碍：占到患者总数10%；
3、智力障碍：患者可出现智力与身体发育障碍。