通常胃蛋白酶＞100ng/ml属于异常，所以其正常范围是1-100ng/ml。实际上临床胃蛋白酶的检测，分为胃蛋白酶原Ⅰ和胃蛋白酶原Ⅱ，需要综合评估。胃蛋白酶原Ⅰ是胃窦的主细胞分泌，如果该值升高，说明胃窦主细胞的功能较为活跃，通常提示有急性胃部炎症，包括溃疡性疾病等引起胃酸分泌增高的疾病。
胃蛋白酶原Ⅱ主要体现的是胃底腺管萎缩、肠化、非典型增生的过程。所以发生萎缩性胃炎时，胃蛋白酶原Ⅱ会升高，如果检查发现胃蛋白酶原Ⅱ＞100ng/ml，胃蛋白酶原Ⅰ数值下降，通常说明胃窦的主细胞功能下降，胃萎缩、异型增生、肠化等指标升高。
临床上表现为胃蛋白酶原 Ⅰ和胃蛋白酶原Ⅱ的比值也下降，提示患者存在萎缩性胃炎的可能性较高，这类患者需要及时去医院进行胃镜检查。