神经紊乱通常应用抗焦虑、抗抑郁的药物进行治疗，常用药物如舍曲林、黛力新(氟哌噻吨美利曲辛片)，以及艾司西酞普兰、西酞普兰、百优解(盐酸氟西汀胶囊)，在如文拉法辛、度洛西汀、奥氮平、米氮平等药物进行治疗。治疗周期为6-9个月，药物通常由低剂量开始，逐渐加到有效的维持量。
药物在第1周时通常出现副作用，第2周时副作用会逐渐减少，正面作用逐渐体现，通常1-3个月起效，速度较慢。在应用上述药物不能过度着急，随着症状缓慢消失、症状逐渐稳定后，服用6-9个即可逐渐减量，甚至可停药，部分患者来可能需要维持较小剂量长期服用，大部分 患者能够逐渐减量、停药。