阿莫西林一般可以用于治疗鼻炎、鼻窦炎，尤其是急性鼻炎、急性鼻窦炎。阿莫西林属于广谱抗生素，针对革兰氏阴性、革兰氏阳性的球菌及杆菌，均有较强的杀灭及抑菌作用，在临床上广泛应用。
急性鼻炎常继发于上呼吸道感染，早期多为病毒感染，随着病程延长，可以合并细菌感染而出现鼻塞、流涕、打喷嚏、头痛等症状。此时治疗上可以选用阿莫西林、抗病毒口服液，配合呋麻合剂滴鼻，效果良好。急性鼻窦炎一般与急性鼻炎同时存在，因鼻腔黏膜和鼻窦黏膜相延续。
在机体免疫力下降的情况下，急性鼻炎易过渡到出现急性鼻窦炎，患者表现为鼻塞、流黄脓涕、头痛、嗅觉减退等，全身症状也会加重，出现发热、乏力。治疗上可以选择阿莫西林，配合鼻窦炎口服液，加强局部用药，如生理盐水冲洗鼻腔，布地奈德、呋麻合剂作为鼻腔滴剂效果良好，可促进鼻腔、鼻窦的引流。