脑MR检查是脑部核磁共振的检查，是在磁力线的帮助下看脑部组织、脑血管病如脑出血、脑梗塞、脑肿瘤，以及一些脱髓鞘的疾病。
MR比CT要查的更多、更细、更好，因为MR即核磁共振的检查，可以排除很多一些灌注的问题，可以把大脑扫描得更细致，在CT之后，它不会漏掉一些新发疾病。由于它的功能检查的问题，CT看不到对新发的48小时之内的这种脑梗，但核磁共振可以看到。核磁共振可以看血管、灌注，核磁共振可以看到的东西比CT要多一点，看得要细一点。
还有功能核磁检查，功能核磁检查，甚至可以看到一些癫痫病灶，一些功能性的疾病病灶，都是现在比较新的一些检查。所以MR是核磁共振，脑MR检查就是脑部核磁共振检查，比CT可能要进一步。