患者在口腔溃疡的情况下建议暂不补牙，因为口腔溃疡实际存在创面，当组织面完全暴露的情况下易导致细菌或病毒等感染物质，顺口腔溃疡破口进入机体，因此在溃疡缺乏上皮保护的情况下不宜补牙。
口腔溃疡时进行补牙操作会引起疼痛，常见的复发性口腔溃疡创面为绿豆或黄豆大小且疼痛明显，此时补牙医生需尤为注意避开溃疡部位，可能会导致操作不便。若溃疡部位在口角区或颊黏膜位置，则补牙操作时患者甚至大张嘴也无法做到，而口腔操作中需使用的口镜、器械等用具难免也会碰到溃疡处，造成疼痛。口腔溃疡时患者不进食的情况下可能疼痛有所减轻，而一旦进食或存在口腔内的操作，不慎碰伤溃疡处时会引起明显疼痛。因此，建议将补牙等此类可以择期的治疗，选择在口腔溃疡痊愈的期间进行。
如果患者出现急性牙髓炎导致疼痛难忍、无法入睡、无法进食、坐立不安的情况，当牙疼程度超过溃疡疼痛而必须将其止住时，口腔溃疡时也可补牙，并非绝对禁忌。此时医生小心操作、尽量避开溃疡部位即可，必要时局部涂抹少量麻药可减轻疼痛。但在牙疼止住后便不必继续操作，需等待口腔溃疡痊愈后再行治牙。