两种细菌药物效果没有较大差别，为二联活菌和三联活菌，理论上均比单联活菌效果好。益生菌常使用多联药，在国内市场三联活菌较多，无其他更多联合用药。其具体作用无太大差别，均有一定效果。其适应证以及注意事项如下：
1、适应证：益生菌主要用于消化不良、腹泻、腹胀，使用抗生素后出现肠道菌群失调、菌群紊乱引起的腹泻；
2、注意事项：如双岐三联，双岐三联活菌需要保存在冰箱，使用时不便捷，部分细菌不需保存在冰箱，多数活菌均需要在冰箱进行保存，保存后会影响细菌活性。活菌相 对于细菌来讲，也有其特殊优势，对于肠道微生态调节作用较明显。
因此以上两种药物均有较大作用，可以进行选择性应用。