治疗顽固性过敏性鼻炎的药物，主要是抗过敏药，也可以配合中成药。由于过敏性鼻炎是因为接触过敏原所引起，因此对于过敏性鼻炎的治疗，应先积极查找过敏原，尽量避免过敏原接触。部分患者避免接触过敏原，症状可能就会好转。
某些过敏原可能不太容易发现，或者无法避免，需要在平时注意，每天坚持用海盐水冲洗鼻腔，可以把鼻腔内的过敏原清除。如果明确会接触到过敏原，可以佩戴口罩。如果能够找到明确的过敏原，但是不能避免接触，可以进行免疫治疗，即脱敏治疗。在药物方面，可以选择抗组胺药、抗白三烯的药物，具体选择何种药物，需要根据患者的不同症状以及药物敏感性决定。