盆底肌痉挛的主要临床症状是疼痛。许多产后女性或未经产后的女性、妇科手术后的女性可能会出现盆底肌痉挛，痉挛时会感到疼痛。一些轻度症状的女性可能在性生活时感到疼痛，而一些女性即便不同房，在日常行走时也会感到坠胀和不适的疼痛感。
此外，一些女性在打喷嚏、咳嗽时也会感到疼痛，还有一些女性在解大便和小便、储尿和排尿期间会感到疼痛。所有这些疼痛大都与盆底肌痉挛有很大的关系。
因为盆底肌与盆腔脏器有密切的联系，它们固定了盆腔脏器的正常位置，并掌控着这些器官的正常功能。因此当盆底肌痉挛时，会导致排便、排尿以及阴道不适，出现同房不适，在很大程度上会影响女性的生活质量和家庭和谐。