尿路感染两侧腰部有疼痛，此情况可能就属于上尿路感染。也就是出现肾盂肾炎、输尿管炎，甚至发生感染等。
这时需要多喝水、多排尿，及时清洗会阴部，多休息为主。要及时化验尿常规，评估感染的严重程度。必要时可以做尿培养、血培养等，查找致病菌存在，选择敏感的抗菌素进行治疗。
较为常见的致病菌有金黄色葡萄球菌、大肠埃希氏菌、链球菌，以及淋球菌、支原体、衣原体等。感染发生后要早期使用广谱抗菌素，常见的包括依诺沙星、环丙沙星、阿奇霉素、罗红霉素、头孢地尼、头孢克洛。
静脉输液的药物，有依替米星、莫西沙星、左氧氟沙星，或者是头孢曲松钠、头孢咪唑钠等。一般治疗3-5天，症状会有明显的缓解，5-7天有可能达到临床治愈。在治疗期要以清淡饮食为主，多吃新鲜的青菜、水果，多吃稀饭、面条，适当补充蛋白质。