对于甲状腺结节，最重要的工作就是分辨是良性肿瘤，还是恶性肿瘤。最基础性的检查，是要做甲状腺彩超，甲状腺彩超可以提供很多有利的信息，再分辨甲状腺结节良性还是恶性，同时还需要做甲状腺功能检查。
有一部分甲状腺结节可能会合并有甲状腺功能异常，甲状腺功能异常需要做相应治疗。所以当发现有甲状腺结节时，首先要做的检查就是甲状腺超声检查和甲状腺功能检查，进一步通过甲状腺超声检查之后。
如果有疑似恶性的可能，或没有办法分辨是良性和恶性时要做进一步检查，通常有以下方法：
1、无创： 无创的甲状腺超声造影，超声造影可以提供甲状腺结节血液供应的情况，为良恶性的鉴别提供更进一步的证据，提高分辨的准确率；
2、有创检查：就是做甲状腺穿刺活检，甲状腺穿刺活检分为粗针和细针两类，细针穿刺是做细胞学检查，粗针穿刺是做组织学检查，两个各有利弊。现在用的最多是细针穿刺检查，因为细针穿刺创伤更小，安全性更好。对于相对比较疑难的细针可能不能确诊的病例，可以考虑粗针检查。
最后就是明确结节性质，可以在术中做快速冰冻，在术前还没有明确的情况下，也可以在术中把病灶切除之后做快速的病理学检查，时间大约在半小时左右可以得出结果。
手术医生再根据冰冻检查的结果良性还是恶性，决定进一步手术的方式。 整个对于甲状腺结节良恶性的判断，基本上用到的检查就是这些。