任何药物都有不良反应，结核药物也一样。因为抗结核治疗一般至少是4种抗结核药物联合应用，而且疗程至少是6个月。所以，长期、多种药物联合应用会有很多不良反应。抗结核药物主要是通过肝脏、肾脏代谢，一定要定期监测患者肝功能和肾功能。另外，有些药物对白细胞、血小板会有一定影响，在治疗的过程中，每个月也要定期检查血常规。
耐药结核病患者服用药物会有一些其他副作用，比如卷曲霉素，会引起甲状腺功能异常，喹诺酮类药物以及新上市抗结核药物对心脏功能会有影响，主要表现为心电图QTC间期延长。所以，在服用抗结核药物时，医生会提醒患者定 期进行心电图检查。在医生提醒定期检查一些相关项目时，患者一定要按期复查，都是非常重要的一些复查的检查项目。