多发性子宫肌瘤最好的治疗方法应因人而异，没有最好，只有更好，应根据个人情况个体化治疗。具体治疗方法需结合患者的年龄、生育要求，子宫肌瘤的大小、数量、位置、症状的严重程度等方面，如黏膜下肌瘤，不管大小都要做治疗，可以行宫腔镜下的手术治疗。
如果位于宫底肌壁间，＜5cm的肌瘤可以观察，如果有月经量异常，可以药物治疗。子宫肌瘤的观察治疗，部分肌瘤较小，即使多发，若无月经量增多、痛经，无其它不适，可观察治疗。月经量增多者心理负担较重，可选择药物治疗。药物治疗可应用部分中成药或米非司酮，口服避孕药治疗。
手术治疗可以选择宫腔镜下手术治疗或腹腔镜手术治疗， 宫腔镜手术适合于黏膜下子宫肌瘤患者。腹腔镜手术适合于浆膜下子宫肌瘤，或者宫底肌壁间的子宫肌瘤。其它治疗方法，如高能聚焦超声治疗、微波消融治疗、介入治疗，其中介入治疗就是子宫动脉栓塞术与子宫内膜的消融术，是目前的保守治疗方法。