存在妇科炎症的患者可以注射宫颈癌疫苗，但是前提要进行宫颈阴道检查，明确是否感染HPV。如果注射疫苗之前，患者没有感染HPV，则注射疫苗效果更好。如果注射疫苗之前有某一型HPV感染，这时同样可以注射疫苗，但是由于患者已经感染这一型HPV，因此注射疫苗之后对这一型HPV已经没有保护能力，但是对于其它型的HPV仍有保护能力，特别是HPV高危16型、18型。
因此患者注射宫颈癌疫苗之前，建议进行HPV感染检测，以及宫颈细胞学检测。如果发现宫颈癌已经有细胞病变，则疫苗的保护力会变差，特别是部分患者已经有癌变，则没有必要注射宫颈癌疫苗。妇科炎症，包括真菌或者细菌感染，不影响宫颈癌疫苗的注射。