骨肿瘤是全骨疾病，有骨骼的部位都可能会长有肿瘤，例如颅骨、肋骨、骨盆，但骨肿瘤最常见的好发部位是关节周围。关节可以分为骨端和干垢端，干垢端常见的肿瘤包括恶性和良性，恶性肿瘤包括骨肉瘤、尤文氏肉瘤，良性肿瘤包括动脉瘤样骨囊肿、骨囊肿等。另外还可以发生在骨端，最常见的肿瘤是骨巨细胞瘤。
还可以发生在骺板附近，例如常见的软骨母细胞瘤，通常与骺板密切相关，发生在干垢端和骨端中间，是软骨母细胞瘤最常见的部位。骨肿瘤分为良性和恶性，只要采取正确治疗方式，骨肿瘤有比较好的预后，尤其是良性肿瘤。随着对骨肿瘤认识、研究的深入，部分恶性肿瘤近年来也取得较大进展，例如青少年常见的骨肉瘤，在上个世纪80-90年代，5年生存率大约只有30%，但目前骨肉瘤5年生存率可以达到50%-75%。