核磁共振对人体副作用主要有三点：
1、核磁共振检查过程中，可使患者体内产生一定热量，比如发热或年龄较小患儿可能出现出汗；
2、磁共振检查时，可能对听力造成一定影响。因为磁共振噪音跟其它影像学检查相比，如同有个电钻在耳边响，应该做好耳部防护，可以有效降低核磁共振对听力的伤害；
3、核磁共振仪器较长，扫描时间较长，里面大而圆的通道，可以使患者心理上感到一定恐慌，幽闭恐惧症患者可能不适合做磁共振检查。另外，磁共振检查时，应尽量避免含铁类金属物进入。含铁性金属物一旦进入磁场里面，金属物飞行过程中可能意外造成人员不必要 损伤。
但总体而言，磁共振副作用微乎其微，病人不清楚情况最好跟医生说一声，让医生来做综合评估，可能相对更好。