大三阳转小三阳需要的时间并不确定，可以是几年，也可以是几十年。大三阳转小三阳可以是自身转换，也可以是通过药物抗病毒治疗而发生转换。
据统计，在乙肝的自然病程中，每年有2%-15%的大三阳的人群发生e抗原的血清转换，就是e抗原转阴、e抗体转阳，从大三阳转为小三阳。在这部分人群中，每年有0.5%-1%的人群发生表面抗原的血清转化，表面抗原转阴、表面抗体转阳，这部分人群就出现了临床上的自愈。
另一方面就是大三阳转小三阳，通过抗病毒治疗，应用抗病毒的药物，如核苷类的抗病毒药或者应用聚乙二醇干扰素，可以使大三阳转成小三阳，就是获得e抗原的血清转换。甚至有非常少量的患者也会 发生表面抗原的血清转换，经过抗病毒治疗，发生表面抗原的血清转换，肝功能就会随之恢复正常。
停用抗病毒药物以后，肝功能也处于稳定的状态。这样的患者经过抗病毒治疗获得了临床治愈，是抗病毒治疗的最好结果。