甲状旁腺手术和其它肿瘤手术有很多相似之处，如果要想切除肿瘤，首先要知道肿瘤究竟有几个，究竟是怎么分布的，在什么部位，若术前不能够明确以上情况，则手术难以成功。所以临床中常常遇到不管是医生还是患者，都知道自己有明确的原发性甲状旁腺功能亢进，甚至知道有肿瘤的存在，但是病人和医生，都不敢贸然的接受手术治疗，因为其担心在手术中无法找到微小的有病的腺体，导致手术的失败。
正常甲状旁腺一般都在甲状腺的周围，多数都在甲状腺的后面，但是有的甲状旁腺的位置很奇怪，如其可以在气管后面、食管后面、咽喉后面、胸腺里面、胸腔里面，甚至有发生在心包内的异位甲状旁腺，所以该种情况下，手术前如果没有准确的判断，按常规的进行手术，则必然会导致手术失败，所以这也是甲状旁腺功能亢进手术重要的挑战之一。
甲状旁腺病变最主要、最大的难点在于对甲状旁腺癌的治疗，甲状旁腺癌因为其特殊的位置，有特殊的侵袭的生物学方式，对治疗有很高的要求，国内的报道显示甲状旁腺癌治疗手术的复发率高达70%，甚至80%，所以从这个数字上能看出来甲状旁腺癌的治疗很艰难，具有很大的挑战性。所以不能够因为甲状旁腺体积小，就觉得其治疗容易，要复杂得多，要困难得多。