儿童消化性溃疡大部分在胃、十二指肠，是防御因子与攻击因子失去平衡导致，发病原因包括以下几点：
1、攻击因子：引起消化性溃疡是胃酸过多，胃酸过多后屏障功能下降，还有幽门螺杆菌感染，无论是成人还是孩子，幽门螺杆菌感染的影响相当普遍，也是消化性溃疡的主要原因；
2、防御因子：胃黏膜在疾病状态下供血不足引起消化性溃疡，由于防御因子下降后导致胃黏膜屏障功能下降，另外，碳酸盐碳酸以及氢离子也会导致黏膜失衡；
3、其他：部分儿童心理紧张焦虑，学习压力大，以及儿童的年龄和性别也与该病的发生有关；
4、遗传因素：父母一旦有消化性溃疡，其子女发生消化性溃疡的概率相对更高。