治疗结肠癌的方案是以手术切除为主的综合治疗方案，Ⅰ期、Ⅱ期和Ⅲ期患者常采用根治性的切除加区域淋巴结清扫术，根据癌肿所在部位确定根治切除范围以及手术方式。Ⅳ期患者若出现肠梗阻、严重的肠出血，暂不做根治手术，可行姑息性的手术切除，缓解症状，改善患者的生活质量。
直肠癌根治术后治疗的基础是手术，对于Ⅱ期、Ⅲ期直肠癌，建议术前行放疗、化疗，以缩小肿瘤，降低局部肿瘤的分期而进行根治性手术切除。奥沙利铂联合氟尿嘧啶是现在常见的化疗方案，对于部分Ⅱ期患者和Ⅲ期、Ⅳ期的患者常用，对于有高危因素的直肠癌患者也可以应用这个方案。Ⅳ期直肠癌主要是以化疗为主的综合治疗方案，包括靶向治疗以贝伐珠单抗、西妥昔单抗、瑞戈非尼、呋喹替尼等靶向药物为主。现在比较常见的比较时髦的免疫治疗，对于MSI-H和PDL-1表达＞50%的患者，结肠癌患者也可以应用免疫治疗方法。