胃食管反流病的发病原因有很多，主要是由于胃肠蠕动功能减弱，胃内容物或者消化液反流入食管内引起的综合征。
食管具有从上往下蠕动，把食物依次推送入胃的功能，随后通过胃的蠕动依次将食物排空到肠道。当胃肠蠕动功能减弱时，食物或者消化液会通过胃反流进入食管，损伤食管黏膜引起食管慢性炎症、溃疡或者糜烂，出现胸痛、烧心、胸闷的症状，部分患者还可能会出现咳嗽、哮喘。
在胃镜下面，大多数反流性食管炎可以在食管上表现为糜烂或者溃疡，但是部分胃食管反流病在胃镜下不能明确诊断，即胃镜阴性的胃食管反流病，此时临床医生可通过患者具体症状来判断。