风湿性心内膜炎，按功能最常累及的瓣膜是二尖瓣。二尖瓣作为左心系统中左心房和左心室之间的交通，是较为关键的瓣膜，其中承载压力也较大，可出现二尖瓣回声增强、二尖瓣反流以及关闭不全，甚至出现二尖瓣脱垂。风湿性心内膜炎还会累及主动脉瓣，即左心系统，主动脉受累可出现主动脉关闭不全以及主动脉反流。若二尖瓣和主动脉瓣病变都较严重，后期可能会影响左心结构和功能。
除主动脉瓣和二尖瓣外，风湿性心内膜炎也可以累及右心系统，累及顺序为三尖瓣和肺动脉瓣，两个瓣膜较少受影响。而且很少出现三尖瓣和肺动脉瓣受累，但二尖瓣和主动脉瓣没有受累的情况。多数是单个瓣膜，或二尖瓣和主动脉瓣同时受累，极少出现三个瓣膜同时累及的情况发生。